Научно-исследовательский институт физических исследований (НИИ ФИ) был создан на базе НИИ физики в августе 2024 года. Научно-исследовательский институт физики был основан в мае 2007 года и включил в себя научно-исследовательские лаборатории факультета физики Российского государственного педагогического университета им. А. И. Герцена.

НИИ ФИ им. А. И. Герцена известен научными достижениями в области физики конденсированного состояния и теоретической физики как в Российской Федерации, так и за рубежом, имеет богатые научные традиции.

В настоящий момент НИИФИ включает 3 отдела: Отдел функциональных и перспективных материалов, Отдел теоретической физики, Отдел подготовки кадров высшей квалификации и популяризации науки, а также центр коллективного пользования «Современные методы физических исследований».